Her yük tipi standart bir 20' veya 40' Dry Van konteynere sığmaz ya da onun içinde taşınmaya uygun değildir. Yükünüzün hacmi, ağırlığı, sıcaklık hassasiyeti ve yükleme yöntemi doğru konteyner seçiminde belirleyicidir.

Örneğin hacimli ancak hafif yükler için High Cube (HC) konteynerler tavan yüksekliği avantajı sağlayarak birim navlun maliyetini düşürür. Bozulabilir gıda veya kimyasal maddeler için Reefer (soğutmalı) konteynerler; vinçle üstten yüklenmesi gereken ağır sanayi parçaları için Open Top konteynerler tercih edilmelidir.

Konteyner içi hasarların %70'inden fazlası yetersiz veya hatalı yük sabitlemesinden kaynaklanır. Açık denizdeki dalgalanmalar, virajlı karayolları ve ani frenler sırasında konteyner içindeki paletlerin hareket etmesi ürünlerin kırılmasına ve konteyner dengesinin bozulmasına sebep olur.

Yükün konteyner tabanına homojen yayılması, ağır yüklerin alta, hafiflerin üste yerleştirilmesi kuraldır. Palet aralarındaki boşluklar hava yastıkları (dunnage bags) ile doldurulmalı, ağır tonajlı yükler endüstriyel lashing şeritleri ve takozlarla zemine sabitlenmelidir.

Farklı iklim kuşaklarından geçen konteynerlerde sıcaklık değişimleri nedeniyle çelik duvarlarda yoğuşma (container rain) meydana gelir. Bu durum ambalajların yumuşamasına, koli deformasyonlarına, metal aksamların paslanmasına ve küflenmeye yol açabilir.

Özellikle okyanus aşırı rotalarda veya mevsim geçişlerinde sevk edilen kargolarda konteyner içi tavan ve duvarlara asılan yüksek kapasiteli desikant (nem alıcı jel/torba) kullanımı hayati önem taşır.

Lojistikte en can sıkıcı gizli maliyetlerin başında liman ve armatör ceza tarifeleri gelir. Konteynerin limanda belirlenen serbest süreden (free time) fazla kalması 'Demuraj', konteynerin liman dışına çıkarılıp boş olarak armatöre geç teslim edilmesi ise 'Detention' cezasına neden olur.

Bu maliyetlerin önüne geçmek için gümrük beyannamelerinin önceden hazırlanması, varış limanındaki yerel acente ile eşgüdümlü çalışılması ve karayolu taşıma organizasyonunun konteyner gemiden inmeden hazır hale getirilmesi şarttır.

SOLAS kuralları uyarınca konteynerlerin brüt ağırlığının (VGM - Verified Gross Mass) resmi kantar belgesiyle doğrulanması yasal zorunluluktur. Yanlış bildirilen ağırlıklar gemiye yüklenmenin reddedilmesine yol açar.

Yükleme tamamlandığında ISO 17712 standardına sahip yüksek güvenlikli çelik civata mühür takılmalı; mühür numarası konşimento ve çeki listesindeki numarayla birebir eşleşmelidir.